Дело может быть в "настройке" протокола tcp/ip - в общем я тоже как-то раз мучался, винду даже 3 раза переставлял, думал баг, оказалось, я настраивал протокол tcp/ip для "ускорения соединения по интернету" - ставилось mtu в 576, а потом по локалке все качалось очень медленно... вот так вот, а еще надо проверить правильное обжатие
полный дуплекс 100 мегов - конечно стоит поставить при соединении кросслинком, а тонекоторые сетевухи сделать это забывают... а вообще сейчас свитч более-менее нормальный можно взять за 25 уе и не мучаться с падением интерфейса при выключении 2 компа и глюками при его поднятии
Если все это есть, то погонял бы оба компа на тему передачи данных друг на друга - иногда быают всякие чудеса типа "в одну сторону быстро, в другую медленно", "короткие файлы качаются быстро, большие - медленно".
именно это и было при установке mtu в 576